numba，让你的Python飞起来！
- 2019 年 10 月 4 日
- 筆記
python由于它动态解释性语言的特性，跑起代码来相比java、c++要慢很多，尤其在做科学计算的时候，十亿百亿级别的运算，让python的这种劣势更加凸显。
办法永远比困难多，numba就是解决python慢的一大利器，可以让python的运行速度提升上百倍！
1 什么是numba？
numba是一款可以将python函数编译为机器代码的JIT编译器，经过numba编译的python代码（仅限数组运算），其运行速度可以接近C或FORTRAN语言。
python之所以慢，是因为它是靠CPython编译的，numba的作用是给python换一种编译器。
python、c、numba三种编译器速度对比
使用numba非常简单，只需要将numba装饰器应用到python函数中，无需改动原本的python代码，numba会自动完成剩余的工作。
import numpy as np import numba from numba import jit @jit(nopython=True) # jit，numba装饰器中的一种 def go_fast(a): # 首次调用时，函数被编译为机器代码 trace = 0 # 假设输入变量是numpy数组 for i in range(a.shape[0]): # Numba 擅长处理循环 trace += np.tanh(a[i, i]) return a + trace
以上代码是一个python函数，用以计算numpy数组各个数值的双曲正切值，我们使用了numba装饰器，它将这个python函数编译为等效的机器代码，可以大大减少运行时间。
2 numba适合科学计算
numpy是为面向numpy数组的计算任务而设计的。
在面向数组的计算任务中，数据并行性对于像GPU这样的加速器是很自然的。Numba了解NumPy数组类型，并使用它们生成高效的编译代码，用于在GPU或多核CPU上执行。特殊装饰器还可以创建函数，像numpy函数那样在numpy数组上广播。
什么情况下使用numba呢？
- 使用numpy数组做大量科学计算时
- 使用for循环时
3 学习使用numba
第一步：导入numpy、numba及其编译器
import numpy as np import numba from numba import jit
第二步：传入numba装饰器jit，编写函数
# 传入jit，numba装饰器中的一种 @jit(nopython=True) def go_fast(a): # 首次调用时，函数被编译为机器代码 trace = 0 # 假设输入变量是numpy数组 for i in range(a.shape[0]): # Numba 擅长处理循环 trace += np.tanh(a[i, i]) # numba喜欢numpy函数 return a + trace # numba喜欢numpy广播
nopython = True选项要求完全编译该函数（以便完全删除Python解释器调用），否则会引发异常。这些异常通常表示函数中需要修改的位置，以实现优于Python的性能。强烈建议您始终使用nopython = True。
第三步：给函数传递实参
# 因为函数要求传入的参数是nunpy数组 x = np.arange(100).reshape(10, 10) # 执行函数 go_fast(x)
第四步：经numba加速的函数执行时间
% timeit go_fast(x)
输出：
3.63 µs ± 156 ns per loop (mean ± std. dev. of 7 runs, 100000 loops each)
第五步：不经numba加速的函数执行时间
def go_fast(a): # 首次调用时，函数被编译为机器代码 trace = 0 # 假设输入变量是numpy数组 for i in range(a.shape[0]): # Numba 擅长处理循环 trace += np.tanh(a[i, i]) # numba喜欢numpy函数 return a + trace # numba喜欢numpy广播 x = np.arange(100).reshape(10, 10) %timeit go_fast(x)
输出：
136 µs ± 1.09 µs per loop (mean ± std. dev. of 7 runs, 10000 loops each)
结论：
在numba加速下，代码执行时间为3.63微秒/循环。不经过numba加速，代码执行时间为136微秒/循环，两者相比，前者快了40倍。
4 numba让python飞起来
前面已经对比了numba使用前后，python代码速度提升了40倍，但这还不是最快的。
这次，我们不使用numpy数组，仅用for循环，看看nunba对for循环到底有多钟爱！
# 不使用numba的情况 def t(): x = 0 for i in np.arange(5000): x += i return x %timeit(t())
输出：
408 µs ± 9.73 µs per loop (mean ± std. dev. of 7 runs, 1000 loops each)
# 使用numba的情况 @jit(nopython=True) def t(): x = 0 for i in np.arange(5000): x += i return x %timeit(t())
输出：
1.57 µs ± 53.8 ns per loop (mean ± std. dev. of 7 runs, 1000000 loops each)
使用numba前后分别是408微秒/循环、1.57微秒/循环，速度整整提升了200多倍！
5 结语
numba对python代码运行速度有巨大的提升，这极大的促进了大数据时代的python数据分析能力，对数据科学工作者来说，这真是一个lucky tool ！
当然numba不会对numpy和for循环以外的python代码有很大帮助，你不要指望numba可以帮你加快从数据库取数，这点它真的做不到哈。
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文章转载自公众号 Python大数据分析 ， 作者 朱卫军
