不会编程的同学看过来:新的GEO数据在线分析工具——BART

  • 2019 年 12 月 13 日
  • 筆記

尽管前期我们介绍GEO数据库的时候,讲

此平台有在线版和本地版两种

本地版:https://bitbucket.org/Luisa_amaral/bart

在线版:http://igc1.salk.edu:3838/bart/

文章名:BART: bioinformatics array research tool

DOI:10.1186/s12859-018-2308-x

该工具包括GEO数据分析的批次效应矫正、差异分析、火山图、聚类图、PCA图、富集分析;分析速度快:作者亲测过网页版分析速度,基本10s内出结果操作简单,交互逻辑清楚,容易上手。

该工作平台的总流程图如下图所示,依次流程为:

数据输入→分组和批次→标准化→差异分析→富集分析。