Supp AI使用機器學習來識別補充交互

  • 2019 年 10 月 7 日
  • 筆記

編輯 | TGS 發布 | ATYUN訂閱號
2015年,艾倫人工智慧研究所(Allen institute for Artificial intelligence)發布了語義學者(Semantic Scholar),這是一個公共人工智慧搜索引擎,能夠從超過1.73億份電腦科學和生物醫學期刊論文中提取數據。雖然一時間受到了熱烈的歡迎,但該研究所的研究人員卻並不滿足,他們想要嘗試,把Semantic Scholar基本演算法用於解決醫學研究領域的其他問題上面。

為此,艾倫研究所本周推出了門戶網站Supp AI,幫助使用維生素、礦物質、酶和激素等補充劑的消費者,識別出可能會與之產生不利影響的產品或藥物。——通過一個簡單的搜索欄,輸入常用藥物(如百憂解和沙拉非姆)的商品名和有效藥物成分(氟西汀)的名稱,從支援相互作用的研究論文中彈出句子,同時鏈接到每個來源。

例如,對銀杏補充劑的研究發現,它與華法林和一氧化氮等物質可能存在140種相互作用。

Supp AI不僅可以顯示所有可能與查詢補充物交互的化學物質或藥物,還可以根據相關元數據對證據句進行排序,並對源文件進行優先順序排序。——影響最終排序的因素包括(但不限於)非撤銷研究、臨床試驗、人體研究和近因。

在Supp AI部署之前,2950萬條自動標註的句子被輸入到BERT-DDI模型中(一種補充藥物相互作用證據提取器),促使補充品和藥物CUIs的策展列表被用來刪除不相關的句子,並將相關的證據分組在一起,每個句子都用原始論文的元數據(如標題、作者、發表地點、撤回狀態和發表年份)進行注釋。

為了評估提取句子的品質,研究小組的實驗人員抽取了200個樣本,並手工標記了這些句子中提到的補充語的相互作用。最終結果不負眾望,BERT-DDI模型的準確率為87%,精確度為77%(正確預測的陽性觀測值與總預測陽性觀測值的比值),召回率為96%(分類器找到所有陽性樣本的能力)。

研究人員表示,近期的目標是定期更新Supp AI,將新論文中提取的最新資訊納入語義學者資料庫。未來發布的版本可能會顯示相互作用的嚴重程度,或者可能會建議使用補充劑來增強其他補充劑或藥物的效果,並列出這些補充劑或藥物已被證明有效的場景或情況。

Supp AI網址:https://supp.ai

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