【科研貓·繪圖】優雅版·小提琴圖（帶R程式碼分享）

• 2019 年 10 月 6 日
• 筆記

課前準備，R語言的安裝和配置都OK了嗎？生物資訊系列課程-R語言入門；挖掘GEO速成SCI文章系列教程（3）-R語言基礎。小板凳排排坐，飛飛老師要開課~

上次教程中，我們從最常用的一個圖形入手：箱線圖。給大家講解並繪製了箱線圖，畫出來的圖是這樣子的。

昨天的箱線圖出來後，很多同學覺得還不夠過癮，想知道有沒有更炫酷的畫法來表徵不同組別間的統計數據呢，當然有！

小·提·琴·圖

定義：Violin plot，和Boxplot一樣，也是一種用作顯示一組數據分散情況資料的統計圖，其形狀類似小提琴。它主要用於反映原始數據分布的特徵，還可以進行多組數據分布特徵的比較。

解讀：小提琴圖是【箱線圖】與【核密度圖】的結合，箱線圖展示了分位數的位置，核密度圖則展示了任意位置的密度，通過小提琴圖可以知道哪些位置的數據點聚集的較多，因其形似小提琴而得名。如下圖所示，其外圍的曲線寬度代表數據點分布的密度，中間的箱線圖則和普通箱線圖表徵的意義是一樣的，代表著中位數、上下分位數、極差等。

繪製方法：使用ggplot2包的geom_violin()函數繪製小提琴圖，為了更好地表徵數據分布，再用geom_boxplot()函數疊加一個箱線圖。

繪圖操作：使用科研貓提供的提琴圖·R程式碼，只要提供幾個參數即可：

（1）設置用來繪圖的數據文件；

（2）設置小提琴的顏色，可以是red、blue、green等各種顏色，當你想繪製多種顏色時，使用「random」；

（3）設置x軸的標籤；

（4）設置y軸的標籤

然後直接運行程式碼即可。

只需短短几秒，你就會徹底愛上我們的程式碼，我們的小提琴圖。超高顏值、時尚穿搭，editor都說愛了呢。

講師簡介：

飛飛老師，綽號「小飛鼠」，國家重點實驗室生物資訊學博士，生物資訊及動畫專業雙985學士，有近十年科研繪圖經驗，精通R、Python、Perl等多門程式語言及Photoshop、Illustrator、InDesign、After Effects、Cinema 4D、Maya等製圖軟體，已發表多篇高品質SCI論文（包括10分以上兩篇），並多次操刀設計Journal封面繪圖。授課經驗豐富，已輔導學員完成論文繪圖近千張，輔導發表SCI論文80餘篇。下面我們一起按照由易到難的順序，一起來欣賞一下飛飛老師的大作吧：

1. 初級統計繪圖

2.複雜統計繪圖

3.流程圖、機器學習、三維製圖

4.複雜三維繪圖、雜誌封面

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