• 2021 年 11 月 15 日
• 筆記

我在B站發布了「單細胞轉錄組繪圖」系列影片教程，一共分了9集，共計57分鐘，適合入門single cell和想進階的小伙 …

• 2021 年 11 月 4 日
• 筆記

1. 起因 之前的程式碼(單細胞分析實錄(17): 非負矩陣分解(NMF)程式碼演示)沒有涉及到python語法，只有4個p …

• 2021 年 10 月 30 日
• 筆記

之前寫過三篇和CNV相關的帖子，如果你做腫瘤單細胞轉錄組，大概率看過： 單細胞分析實錄(11): inferCNV的基本 …

• 2021 年 10 月 29 日
• 筆記

一般做完差異分析都會做這一步，目的是找到差異基因富集到的通路，進而與生物學意義聯繫起來。具體的統計方法很簡單，這篇筆記里 …

• 2021 年 10 月 23 日
• 筆記

在我之前的帖子單細胞分析實錄(7): 差異表達分析/細胞類型注釋裡面，我已經介紹了如何使用SingleR給單細胞數據做注 …

• 2021 年 10 月 23 日
• 筆記

一句話評價：小樣本量單細胞轉錄組在冷門疾病領域應用前景尚可，常規套路也能發NC 1. Title 標題可以看出本研究的主 …

• 2021 年 7 月 25 日
• 筆記

在上一篇帖子中，我介紹了CellPhoneDB的原理、實際操作，以及一些值得注意的地方。這一篇繼續細胞通訊分析的可視化。 …

• 2021 年 7 月 24 日
• 筆記

細胞通訊分析可以給我們一些細胞類群之間相互調控/交流的資訊，這種細胞之間的調控主要是通過受配體結合，傳遞訊號來實現的。不 …

• 2021 年 7 月 23 日
• 筆記

下午花了兩個小時回答讀者的疑問，覺得可以記錄下來，也許能幫到一部分人。 第一位讀者做的是非模式物種的單細胞。 一開始以為 …

• 2021 年 7 月 22 日
• 筆記

前幾天分析了一批單細胞TCR的數據，需要畫這樣一個圖： 行是不同的樣本，列是不同的T細胞類型，每一個位置點的大小表示T細 …