醫學影像分割-在3DSlicer中使用NVIDIA 的AI輔助工具NvidiaAIAssistedAnnotation自動切割醫學影像教程
- 2020 年 4 月 5 日
- 筆記
前期準備
下載3DSlicer並安裝:
3DSlicer官網(http://www.slicer.org)或者直接下載(https://download.slicer.org),需要注意目前該插件只支援最新的3DSlicer Preview版本(4.11.x)
官網下載速度慢,直接百度網盤:
鏈接:https://pan.baidu.com/s/1WqaIQEWaMXgHVp4QkxwlFQ
提取碼:cms1
安裝插件(擴展工具)
如圖:
點擊【Install Slicer Extensions】按鈕進入安裝插件頁
在右上角搜索我們需要的插件,然後安裝,安裝完成點擊【Restart】按鈕重啟3DSlicer,插件安裝完畢
影像切割
如圖:按步驟導入我們要處理的醫學影像(此處我們以分割單個nii格式影像為例)
點擊【Segment Editor】按鈕,進入影像分割頁
然後找到【Effects】欄,選擇【Nvidia AIAA】,如圖:然後在【Auto-segmentation】欄的Model欄選擇【segmentation_ct_liver_and_tumor】,在點擊【start】按鈕開始自動切割
切割結果如圖:
需要注意:在【Nvidia AIAA Server】欄,默認使用3DSlicer遠程伺服器,有時候會連接不上,你可以設置自己的伺服器,參見我其他教程。