使用pybind11為Python編寫C++擴展(一)配置篇:Build(編譯和鏈接)
最後決定選用pybind11
,理由如下:
- 比python原生的C API看起來人性多了
- 我的C++程式碼不是現成的,需要一定的C++開發工作量,所以感覺cython不是很方便。如果C++介面已經給好了,只需要簡單包裝一下,Cython可能更好。
- pybind11聲稱只包含頭文件,且能通過pip安裝,感覺比boost_python輕量且最後這個擴展包容易分發。此外,感覺它的文檔也比boost python友好不少……
Setuptools
這種方式適合python包的構建、打包、分發、上傳到PyPi一條龍服務。python使用C++擴展需要在setup.py
里配置好Extension
。以下是一個setup.py
的樣例:
import glob
import os.path
from distutils.core import setup
__version__ = "0.0.1"
# make sure the working directory is BASE_DIR
BASE_DIR = os.path.dirname(__file__)
os.chdir(BASE_DIR)
ext_modules = []
try:
from pybind11.setup_helpers import Pybind11Extension, ParallelCompile, naive_recompile
# `N` is to set the bumer of threads
# `naive_recompile` makes it recompile only if the source file changes. It does not check header files!
ParallelCompile("NPY_NUM_BUILD_JOBS", needs_recompile=naive_recompile, default=4).install()
# could only be relative paths, otherwise the `build` command would fail if you use a MANIFEST.in to distribute your package
# only source files (.cpp, .c, .cc) are needed
source_files = glob.glob('source/path/*.cpp', recursive=True)
# If any libraries are used, e.g. libabc.so
include_dirs = ["INCLUDE_DIR"]
library_dirs = ["LINK_DIR"]
# (optional) if the library is not in the dir like `/usr/lib/`
# either to add its dir to `runtime_library_dirs` or to the env variable "LD_LIBRARY_PATH"
# MUST be absolute path
runtime_library_dirs = [os.path.abspath("LINK_DIR")]
libraries = ["abc"]
ext_modules = [
Pybind11Extension(
"package.this_package", # depends on the structure of your package
source_files,
# Example: passing in the version to the compiled code
define_macros=[('VERSION_INFO', __version__)],
include_dirs=include_dirs,
library_dirs=library_dirs,
runtime_library_dirs=runtime_library_dirs,
libraries=libraries,
cxx_std=14,
language='c++'
),
]
except ImportError:
pass
setup(
name='project_name', # used by `pip install`
version='0.0.1',
description='xxx',
ext_modules=ext_modules,
packages=['package'], # the directory would be installed to site-packages
setup_requires=["pybind11"],
install_requires=["pybind11"],
python_requires='>=3.8',
include_package_data=True,
zip_safe=False,
)
一些需要注意的點(坑):
-
如果需要通過sdist(即
.tar.gz
的源碼方式)發布包的話,Extension
的source_files
欄位必須是相對路徑。否則build的時候會因為egg-info
里的SOURCE.txt
里有絕對路徑而報錯。但由此帶來的問題是我們不能確定跑setup.py
的時候工作目錄是啥,為了保險起見,需要把它設置成setup.py
所在的目錄。 -
在安裝包之前,為了獲取一些metadata,setuptools會先跑一次
setup.py
,這個時候如果沒有裝pybind11
,會報錯。為了解決這個問題:- 為了能正常執行到
setup
函數,我們需要先保證沒有pybind11
的情況下執行這個文件也不會報錯。所以我們需要把所有依賴pybind11.setup_helpers
的部分都放到try里。
也有其它的方法,比如直接複製一個setup_helpers啥的,具體可以看文檔。
- 根據setuptools的文檔,
setup_requires
並不會安裝包,所以pybind11
也需要加到install_requires
里。 - 最後,在安裝本包前,setuptools會先安裝依賴項,然後再跑
setup.py install
,這時就可以成功build和安裝了。
- 為了能正常執行到
-
如果你的外接庫不在系統查找動態庫的指定路徑里,那麼指定link_dirs之後,編譯和鏈接不會出錯。但執行的時候還是會因為找不到動態庫而報錯。可以通過添加
runtime_library_dirs
(等價於-Wl,-rpath
),或者給LD_LIBRARY_PATH
環境變數里添加這個路徑。 -
編譯後的
.so
的位置,以及你的C++ module在python里的名字,取決於你給Extension
寫的名字。例如,你希望文件結構是這樣:project_dir |-- package | |-- __init__.py | |-- this_package.xxxx.so | |-- other.py |-- setup.py
這樣你最後在
site-packages
里只會新建一個包叫package
。此外,哪怕你這個project只想導出一個
.so
里的模組,把它放到一個文件夾里包裝起來也會更好。因為如果你只想導出一個this_package
,把setup函數里的配置改成了packages=['this_package']
,這個.so
文件會直接被加到site-packages
,感覺不是很優雅。這時候你的
Extension
的名字就需要是package.this_package
。這樣.so
的位置就是對的,你運行import package.this_package
就會正確地找到.so
並執行了。
但是,要保證執行.so
不出錯,在C++里通過PYBIND11_MODULE
把這個擴展expose到python里的時候,名字也要對應:PYBIND11_MODULE(this_package, m) {}
CMake
參考官方的CMake構建文檔。
如果是編譯嵌入python的C++程式,可以用CMake,比較方便。
雖然python extension似乎也可以用CMake,但是還是setuptools比較方便。
我這裡主要是用CMake編譯C++部分的測試。CMakeLists.txt
大概長這樣:
# the CMakeList to test the C++ part from a C entry point
cmake_minimum_required(VERSION 3.21)
project(project_name)
set(CMAKE_CXX_STANDARD 14)
# Find pybind11
find_package(pybind11 REQUIRED)
# If any library (e.g. libabc.so) is needed
include_directories(INCLUDE_DIR)
link_directories(LINK_DIR)
# Add source file
file(GLOB A_NAME_FOR_SOURCE CONFIGURE_DEPENDS "source/path/*.cpp")
file(GLOB A_NAME_FOR_TEST CONFIGURE_DEPENDS "test/path/*.cpp")
add_executable(TARGET_NAME test_cpp_part.cpp ${A_NAME_FOR_SOURCE} ${A_NAME_FOR_TEST})
target_link_libraries(TARGET_NAME abc pybind11::embed)
project_name
隨便寫TARGET_NAME
隨便寫,只要add_executable
和target_link_libraries
對應就行,是最後的可執行文件的名字A_NAME_FOR_SOURCE
和A_NAME_FOR_TEST
是一個CMake的中間變數名,隨便寫,它們分別代表了GLOB找到的一堆源文件,和用於測試的一堆文件INCLUDE_DIR
里是庫abc的頭文件,LINK_DIR
里必須包含庫文件,動態庫類似libabc.so
,靜態庫類似libabc.a
。- Link到
pybind11::embed
的原因是防止帶python對象的那部分C++程式碼編譯失敗。