單細胞轉錄組繪圖影片教程
我在B站發布了「單細胞轉錄組繪圖」系列影片教程,一共分了9集,共計57分鐘,適合入門single cell和想進階的小夥伴。
1. 數據預處理and腫瘤樣本去不去批次
(這個圖是沒有去批次的)
2. tsne或者umap降維圖的一般畫法
3. 左下角的坐標軸怎麼畫
其實是用線段代替了坐標軸
4. 散點圖加等高線加二維密度圖
nature那篇的繪圖還有個大圓圈,最後把它倆組合起來就可以了,後期全靠AI
5. 計算基因集分數_投影圖
6. 熱圖展示marker基因
7. 氣泡圖展示marker基因
8. 堆疊小提琴圖展示marker基因
9. 條形圖展示細胞亞群佔比and質控圖
共重號回復
20211114
有程式碼和示例數據的獲取方式
因水平有限,有錯誤的地方,歡迎批評指正!