數據平台建設哪家強？
- 2019 年 10 月 4 日
- 筆記
生物資訊分析離不開數據資源和資料庫，生物資訊學資料庫分類概覽 (第一版)系統梳理了常用功能資料庫。
下面再分析2個NAR發表的新資料庫，以饗讀者。
中醫藥方劑的資料庫，收錄方劑、藥材、靶點、疾病、通路等資訊，
網站古色古香，設計精美，交互探索，網路大氣，
高顏值是很好的敲門磚，
於2018年發表於NAR雜誌。
表格展示太枯燥，關鍵資訊互動式餅圖展示，查看，點擊篩選~~
現在資料庫升級第二版，更多功能，更多展示 （網路圖比下面這個更漂亮，更有生物意義，更有交互性，只是暫時還不能釋放 o(╥﹏╥)o）。
另一個是`Prophage hunter`，在細菌基因組中尋找活性噬菌體。
頁面極簡，但設計精良，訂製基因組瀏覽器交互，
於2019年發表於NAR雜誌。
表格和基因組瀏覽器的雙向控制
做的更多的還是分子數據的展示，如轉錄組相關數據的展示。
首先展示下首頁，專業設計師私人訂製，可以傳統，可以現代；可以功能為主，也可以輪播酷炫。
- 首頁搜索框全局搜索，類似Google，輸入基因名、通路名、功能關鍵詞皆可搜索。
- 小輪播展示網站可做的分析和結果展示，差異基因富集全套，還是互動式的。
- 四個餅圖聯動展示資料庫收錄的樣品和屬性資訊，高端大氣顯內涵。
那搜索一下，都展示哪些資訊？
基因，別名，公共資料庫鏈接，功能注釋，表達分布，PPI網路，共表達網路，想放啥放啥！
一個基因嫌少，來繪製一組基因的表達譜，修飾譜；同時展示甲基化修飾與基因表達的關係。
圖就不展示了，絕對心中所想！
搜索太簡單了（其實功能很強大），可否更多條件搜索？
多組學如何展示？基因組瀏覽器可否嵌入？
基因組瀏覽器是多組學的展示利器，更多見：
ChIP類數據同時展示IP, Input樣品丰度 （這個雙峰圖可拆可合）和peak資訊，見下圖。
展示同源物種，也可以~
更多在線功能，樣品聚類、篩選、差異基因（樣品特異性基因）、功能富集 （一個小的雲平台出來了）
更多互動式圖，染色體圖譜、餅圖、箱線圖、互動式表
資料庫收錄樣本資訊更多互動展示
這也是一個主頁風格，隨您訂製。
更多地圖展示
時間軸變化來一個
訪問量統計頁來一個 （這是高顏值可訂製在線繪圖工具-第三版的用戶訪問，總訪問量近10萬，給您做個友情鏈接，也能推廣帶動訪問）
以上列出一部分，更多資料庫還在建設中，發表後慢慢釋放，更多展示和需求也等您提出。
