不會編程的同學看過來:新的GEO數據在線分析工具——BART

  • 2019 年 12 月 13 日
  • 筆記

儘管前期我們介紹GEO資料庫的時候,講

此平台有在線版和本地版兩種

本地版:https://bitbucket.org/Luisa_amaral/bart

在線版:http://igc1.salk.edu:3838/bart/

文章名:BART: bioinformatics array research tool

DOI:10.1186/s12859-018-2308-x

該工具包括GEO數據分析的批次效應矯正、差異分析、火山圖、聚類圖、PCA圖、富集分析;分析速度快:作者親測過網頁版分析速度,基本10s內出結果操作簡單,交互邏輯清楚,容易上手。

該工作平台的總流程圖如下圖所示,依次流程為:

數據輸入→分組和批次→標準化→差異分析→富集分析。