MethSurv——一個優秀的TCGA甲基化分析工具
- 2019 年 10 月 7 日
- 筆記
談起TCGA分析工具,我知道你肯定要說什麼 GEPIA,cbioportal……, 但是 TCGA甲基化呢? 這些碉堡的神器瞬間就黯然失色了吧,數風流神器,還看白介素同學推薦,首先來看下今天要分享的神器有哪些NB功能吧:
MethSurv網頁地址:https://biit.cs.ut.ee/methsurv/
感興趣的基因甲基化位點與預後的關係,生存曲線:

一鍵出圖,甲基化分布情況:

超級酷的小提琴圖,展示甲基化與感興趣的臨床表現之間的關係:

高顏值圖片全部可用直接下載,放到自己的paper中的,計算出 HR,提供一系列其它資料庫的鏈接, genecards, COSMIC, GO資料庫等。

還可根據染色體選擇分析:


分析感興趣的基因甲基化在多腫瘤中的關係,隨時出圖 KM plot

提供各種腫瘤中的 Top biomarker

還有驚喜,超酷的熱圖免費送,自動出圖,可以拿去發表了

本科研神器還提供數據下載,即甲基化位點在TCGA腫瘤中的預後分析,單因素和多因素都有,且提供TCGA甲基化數據的矩陣數據,已經處理好了,拿來即用!

好了,今天的內容就分享到這,想要這個神器嘛???