• 2021 年 11 月 15 日
• 笔记

我在B站发布了“单细胞转录组绘图”系列视频教程，一共分了9集，共计57分钟，适合入门single cell和想进阶的小伙 …

• 2021 年 11 月 4 日
• 笔记

1. 起因 之前的代码(单细胞分析实录(17): 非负矩阵分解(NMF)代码演示)没有涉及到python语法，只有4个p …

• 2021 年 10 月 30 日
• 笔记

之前写过三篇和CNV相关的帖子，如果你做肿瘤单细胞转录组，大概率看过： 单细胞分析实录(11): inferCNV的基本 …

• 2021 年 10 月 29 日
• 笔记

一般做完差异分析都会做这一步，目的是找到差异基因富集到的通路，进而与生物学意义联系起来。具体的统计方法很简单，这篇笔记里 …

• 2021 年 10 月 23 日
• 笔记

在我之前的帖子单细胞分析实录(7): 差异表达分析/细胞类型注释里面，我已经介绍了如何使用SingleR给单细胞数据做注 …

• 2021 年 10 月 23 日
• 笔记

一句话评价：小样本量单细胞转录组在冷门疾病领域应用前景尚可，常规套路也能发NC 1. Title 标题可以看出本研究的主 …

• 2021 年 7 月 25 日
• 笔记

在上一篇帖子中，我介绍了CellPhoneDB的原理、实际操作，以及一些值得注意的地方。这一篇继续细胞通讯分析的可视化。 …

• 2021 年 7 月 24 日
• 笔记

细胞通讯分析可以给我们一些细胞类群之间相互调控/交流的信息，这种细胞之间的调控主要是通过受配体结合，传递信号来实现的。不 …

• 2021 年 7 月 23 日
• 笔记

下午花了两个小时回答读者的疑问，觉得可以记录下来，也许能帮到一部分人。 第一位读者做的是非模式物种的单细胞。 一开始以为 …

• 2021 年 7 月 22 日
• 笔记

前几天分析了一批单细胞TCR的数据，需要画这样一个图： 行是不同的样本，列是不同的T细胞类型，每一个位置点的大小表示T细 …