文獻解讀:一篇利用數據挖掘+實驗的文章 常用基礎科研套路
- 2019 年 10 月 6 日
- 筆記
如果你想做實驗,但是想不到課題,那就用數據挖掘選題吧!讓我們一起挖挖挖!!!
這裡分享一篇利用數據挖掘+實驗的文章,這篇文章發表在BMC Cancer上,IF為3.28。
題目:
ACTL6A expression promotes invasion,metastasis and epithelial mesenchymal transition of colon cancer
文章來源:https://doi.org/10.1186/s12885-018-4931-3
這篇文章是研究ACTL6A表達對結腸癌侵襲、轉移、上皮間充質轉化的影響。下面,我們來分析一下作者是怎麼樣做這個課題?
第一步,下載GEO數據進行分析,進行差異分析,證明ACTL6A在結腸癌中高表達(與正常組織相比),然後在oncomine中進行驗證,ACTL6A在結腸癌中也是高表達。

第二步,有了第一步的結果,我們可以設計實驗了,收集病人樣本,提取RNA,進行定量PCR,結果發現ACTL6A也是高表達的,然後進行免疫組化驗證,在蛋白水平也存在高表達。


第三步,探討ACTL6A表達與臨床不良性狀的相關性

第四步,進行體外實驗,證明ACTL6A表達會促進結腸癌細胞轉移,侵襲


第五步,進行體外實驗,證明ACTL6A 誘導結腸癌細胞上皮間充質轉化


做完上面的分析就可以下結論:ACTL6A表達促進結腸癌侵襲、轉移、上皮間充質轉化。