EnhancerAtlas:人和小鼠的增強子數據庫

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EnhancerAtlas結合三種高通量數據的分析結果來預測人和小鼠中的增強子，該數據庫最新版本為v2.0, 網址如下

http://www.enhanceratlas.org/index2.php

對於人類增強子，基於hg19基因組版本進行預測，目前包含來自170種細胞或組織共共4,506,217個增強子信息；對於小鼠增強子，基於mm9基因組版本進行預測，目前包含來自150種細胞或組織共2,811,699個增強子信息。

支持直接輸入基因名稱或者基因組特定區域，查看在該區域內的增強子，示意如下

檢索結果示意如下

採用了基因組瀏覽器的展示形式，每一行稱之為track, 黑色字體對應行表示每種方法檢測到的該區域reads覆蓋結果，紅色字體對應行為綜合多種方法得到的增強子區域的結果。

在結果頁面，可以下載該區域包含的增強子的fasta序列文件，示意如下

也可以比較增強子在不同細胞系中的表達，檢索框示意如下

檢索結果示意如下

可以直觀比較不同細胞系中增強子的表達情況。該數據庫還支持展示增強子和基因之間的調控網絡，檢索框示意如下

調控網絡的結果如下所示

除了在線檢索功能外，該數據庫中的數據還可以免費下載，無論是不同細胞系中增強子區間，還是增強子和基因間的調控網絡，都可以直接下載得到。對於增強子研究而言，該數據庫非常值得參考。

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