如何使用Gephi工具進行可視化複雜網絡圖
- 2021 年 2 月 8 日
- 筆記
在Gephi安裝官網中也介紹了一些如何使用該工具的方法，我將根據自己的數據和可視化的圖片進行介紹
第一步：整理數據格式，我的數據是.csv格式的（.xlsx，.xls等等）
數據第一行第一列必須是相同的，表示節點的標籤，可以不用數字表示（如：N1,M2,B3等等任意形式表示，注意行列必須是相同的）
剩下數字表示節點之間的連接權重大小（不一定非要有連接表示為1，沒有連接關係表示為0，如0.87,0.01等等都可以的）
當然除了這種節點和邊在一起表示的對稱矩陣外，還可以單獨表示節點和邊序列的形式，這裡先介紹第一種
第二步：開始導入Gephi中進行可視化啦
打開gephi工具後可以看見上面的界面，可以點擊新建工程，當然還可以瀏覽左側進來打開的工程。
點擊文件中的打開，選擇數據存儲的位置後，點擊打開，打開後將顯示下面的界面
紅色框中的格式一般不需要修改（我認為軟件自動識別出了你的數據格式），點擊下一步
這個界面中的紅色框也不需要修改，直接完成就可以了。
在這個界面中可以修改兩項，第一圖的類型（混合的，無向的，有向的）
這裡我習慣用無向的，因為數據點和連邊較多，所以這個根據自己數據選擇合適的就好
第二個是可以新建工作區或者添加到當前的工作區
新建工作區會將導入的數據顯示在各自的工區內
（我選擇是新建工作區，將顯示兩個工作區）
而添加到當前存在的工作區將所有數據疊加在一起（只顯示當時存在的工作區）
成功後，將在界面中心顯示網絡圖（點擊圖上的節點可以拖動節點的位置）
第二步：美化網絡
首先調整網絡的布局，可以點擊進行試驗，選擇合適的布局
這張圖是選擇布局後將上面繁密的點進行了分散操作
下一步將調整節點和邊的大小、顏色（可以點擊窗口中的外觀，一般是直接現在上面）
點擊每個圖標上面都有文字說明
在紅色框出現的顏色位置右鍵，將出現右邊的調色板，根據喜好調整節點顏色，同理邊的顏色調整方法也是一樣的
選擇好顏色後點擊0k就可以了，並沒有結束，切記一定要點擊右下角應用才可以
還可以根據節點的度不同顯示深淺不一的節點顏色
邊和節點的設置是一樣的，只要鼠標點擊邊就可以改變邊的屬性了，可以調整邊的顏色，還可以根據邊的權重打下顯示深淺不一的顏色
當然旁邊還有顏色組合板供選擇
輔助工具：可以點擊圖標會有相應的文字說明，我標記了幾個常用的圖標，（可以任意手動修改節點和邊，很好！！！）
如果顏色不滿意，可以點擊下面的灰色圖標進行重置
下面介紹一下節點顯示標籤的設置
點擊標籤屬性後可以選擇顯示的內容
可以點擊數據資料查看節點和邊顯示的具體數值
可以點擊複製列數據（顯示標籤進行使用，不過一般不需要）
這樣就顯示出複製的一列了
界面布局可以自己設置，下面是我的界面
這裡提示一下，如果點擊哪個選項不出現，則可以點擊窗口再選擇對應的操作名稱
這個軟件的好處是可以直接點擊進行計算網絡的一些評估指標（點擊運行就OK）
下一步點擊預覽，在預設置中可以更精細的修改網絡圖（不顯示曲邊，節點和邊的透明度，節點邊的顏色和大小，邊框顏色等等）
最後一步將圖片輸出，同時點擊另存為將整個工作區進行保存，下次點擊直接進行繼續修改（否則將很難再生成一樣的網絡圖）
另存為將保存兩個文件
下次點擊.gephi文件將進入上次的操作界面接續完善和美化
到此Gephi多有的基本操作都講述完了，這是我自己在應用中使用的一些，如果還有什麼新的發現我將繼續補充
當然更希望互相學習，多多留言交流喲！
附我用一周學習的成果（開始很醜-慢慢變好）
