单细胞转录组绘图视频教程
我在B站发布了“单细胞转录组绘图”系列视频教程,一共分了9集,共计57分钟,适合入门single cell和想进阶的小伙伴。
1. 数据预处理and肿瘤样本去不去批次
(这个图是没有去批次的)
2. tsne或者umap降维图的一般画法
3. 左下角的坐标轴怎么画
其实是用线段代替了坐标轴
4. 散点图加等高线加二维密度图
nature那篇的绘图还有个大圆圈,最后把它俩组合起来就可以了,后期全靠AI
5. 计算基因集分数_投影图
6. 热图展示marker基因
7. 气泡图展示marker基因
8. 堆叠小提琴图展示marker基因
9. 条形图展示细胞亚群占比and质控图
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20211114
有代码和示例数据的获取方式
因水平有限,有错误的地方,欢迎批评指正!