做一个logitic分类之鸢尾花数据集的分类
- 2019 年 10 月 3 日
- 筆記
做一个logitic分类之鸢尾花数据集的分类
Iris 鸢尾花数据集是一个经典数据集，在统计学习和机器学习领域都经常被用作示例。数据集内包含 3 类共 150 条记录，每类各 50 个数据，每条记录都有 4 项特征：花萼长度、花萼宽度、花瓣长度、花瓣宽度，可以通过这4个特征预测鸢尾花卉属于（iris-setosa, iris-versicolour, iris-virginica）中的哪一品种。
首先我们来加载一下数据集。同时大概的展示下数据结构和数据摘要。
import numpy as np import pandas as pd import matplotlib.pyplot as plt data = pd.read_csv('./data/iris.csv') print(data.head()) print(data.info()) print(data['Species'].unique()) Unnamed: 0 Sepal.Length Sepal.Width Petal.Length Petal.Width Species 0 1 5.1 3.5 1.4 0.2 setosa 1 2 4.9 3.0 1.4 0.2 setosa 2 3 4.7 3.2 1.3 0.2 setosa 3 4 4.6 3.1 1.5 0.2 setosa 4 5 5.0 3.6 1.4 0.2 setosa <class 'pandas.core.frame.DataFrame'> RangeIndex: 150 entries, 0 to 149 Data columns (total 6 columns): Unnamed: 0 150 non-null int64 Sepal.Length 150 non-null float64 Sepal.Width 150 non-null float64 Petal.Length 150 non-null float64 Petal.Width 150 non-null float64 Species 150 non-null object dtypes: float64(4), int64(1), object(1) memory usage: 7.2+ KB None ['setosa' 'versicolor' 'virginica']通过上述数据的简单摘要，我们可以得到鸢尾花一共有三类：
- setosa
- versicolor
- virginica
我们分别用0,1,2来表示[‘setosa’ ‘versicolor’ ‘virginica’]
整理
首先，我们对数据集进行一个简单的整理。我们需要把分类替换成0,1,2
其次，我们把数据集分成两个分类，一个用来训练我们的logitic算法的参数，另外一个用来测试我们的训练的结果
以下是代码：
# 数值替换 data.loc[data['Species']=='setosa','Species']=0 data.loc[data['Species']=='versicolor','Species']=1 data.loc[data['Species']=='virginica','Species']=2 print(data) Unnamed: 0 Sepal.Length Sepal.Width Petal.Length Petal.Width Species 0 1 5.1 3.5 1.4 0.2 0 1 2 4.9 3.0 1.4 0.2 0 2 3 4.7 3.2 1.3 0.2 0 3 4 4.6 3.1 1.5 0.2 0 4 5 5.0 3.6 1.4 0.2 0 .. ... ... ... ... ... ... 145 146 6.7 3.0 5.2 2.3 2 146 147 6.3 2.5 5.0 1.9 2 147 148 6.5 3.0 5.2 2.0 2 148 149 6.2 3.4 5.4 2.3 2 149 150 5.9 3.0 5.1 1.8 2 [150 rows x 6 columns]#分割训练集和测试集 train_data = data.sample(frac=0.6,random_state=0,axis=0) test_data = data[~data.index.isin(train_data.index)] train_data = np.array(train_data) test_data = np.array(test_data) train_label = train_data[:,5:6].astype(int) test_label = test_data[:,5:6].astype(int) print(train_label[:1]) print(test_label[:1]) train_data = train_data[:,1:5] test_data = test_data[:,1:5] print(np.shape(train_data)) print(np.shape(train_label)) print(np.shape(test_data)) print(np.shape(test_label))[[2]] [[0]] (90, 4) (90, 1) (60, 4) (60, 1)我们需要把label编程1ofN的样式
经过上述两步的操作，我们可以看到数据集被分成两个部分。我们接下来对数据进行logitic分类。
train_label_onhot = np.eye(3)[train_label] test_label_onhot = np.eye(3)[test_label] train_label_onhot = train_label_onhot.reshape((90,3)) test_label_onhot = test_label_onhot.reshape((60,3))print(train_label_onhot[:3])[[0. 0. 1.] [0. 1. 0.] [1. 0. 0.]]分类
思路
我选选择先易后难的方法来处理这个问题：
如果我们有两个分类0或者1的话，我们需要判断特征值X（N维）是否可以归为某个分类。我们的步骤如下:
- 初始化参数w（1，N）和b(1)
- 计算 (z = sum_{i=0}^{n}w*x + b)
- 带入(sigma)函数得到(hat{y}=sigma(z))
现在有多个分类, 我们就需要使用one-to-many的方法去计算。简单的理解，在本题中，一共有3个分类。我们需要计算(hat{y}_1)来表明这个东西是分类1或者不是分类1的概率 (hat{y}_2)是不是分类2的概率，(hat{y}_3)是不是分类3的概率。然后去比较这三个分类那个概率最大，就是哪个的概率。
比较属于哪个概率大的算法，我们用softmat。就是计算(exp(hat{y}_1)),(exp(hat{y}_2)),(exp(hat{y}_3)),然后得到属于三个分类的概率分别是
- p1=(frac{exp(hat{y}_1)}{sum_{i=0}{3}(hat{y}_i)})
- p1=(frac{exp(hat{y}_2)}{sum_{i=0}{3}(hat{y}_i)})
- p1=(frac{exp(hat{y}_3)}{sum_{i=0}{3}(hat{y}_i)})
我们根据上述思想去计算一条记录,代码如下:
def sigmoid(s): return 1. / (1 + np.exp(-s)) w = np.random.rand(4,3) b = np.random.rand(3) def get_result(w,b): z = np.matmul(train_data[0],w) +b y = sigmoid(z) return y y = get_result(w,b) print(y) [0.99997447 0.99966436 0.99999301]上述代码是我们只求一条记录的代码，下面我们给他用矩阵化修改为一次计算全部的训练集的(hat{y})
def get_result_all(data,w,b): z = np.matmul(data,w)+ b y = sigmoid(z) return y y=get_result_all(train_data,w,b) print(y[:10])[[0.99997447 0.99966436 0.99999301] [0.99988776 0.99720719 0.9999609 ] [0.99947512 0.98810796 0.99962362] [0.99999389 0.99980632 0.999999 ] [0.9990065 0.98181945 0.99931113] [0.99999094 0.9998681 0.9999983 ] [0.99902719 0.98236513 0.99924728] [0.9999761 0.99933525 0.99999313] [0.99997542 0.99923594 0.99999312] [0.99993082 0.99841774 0.99997519]]接下来我们要求得一个损失函数，来计算我们得到的参数和实际参数之间的偏差，关于分类的损失函数，请看这里
单个分类的损失函数如下：
[loss=−sum_{i=0}^{n}[y_ilnhat{y}_i+(1−y_i)ln(1−hat{y}_i)]]
损失函数的导数求法如下
当 (y_i=0)时
w的导数为：
[ frac{dloss}{dw}=(1-y_i)*frac{1}{1-hat{y}_i}*hat{y}_i*(1-hat{y}_i)*x_i ]
化简得到
[ frac{dloss}{dw}=hat{y}*x_i=(hat{y}-y)*x_i ]
b的导数为
[ frac{dloss}{db}=(1-y_i)*frac{1}{1-hat{y}_i}*hat{y}_i*(1-hat{y}_i) ]
化简得到
[frac{dloss}{db}=hat{y}-y]
当(y_i)=1时
w的导数
[ frac{dloss}{dw}=-yi*frac{1}{hat{y}}*hat{y}(1-hat{y})*x_i ]
化简
[ frac{dloss}{dw}=(hat{y}-1)*x_i=(hat{y}-y)*x_i ]
b的导数
[frac{dloss}{dw}=hat{y}-y]
综合起来可以得到
[ frac{dloss}{dw}=sum_{i=0}^{n}(hat{y}-y)*x_i ]
[ frac{dloss}{db}=sum_{i=0}^{n}(hat{y}-y) ]
我们只需要根据以下公式不停的调整w和b,就是机器学习的过程
[w=w-learning_rate*dw]
[b=b-learning_rate*db]
下面我们来写下代码：
learning_rate = 0.0001 def eval(data,label, w,b): y = get_result_all(data,w,b) y = y.argmax(axis=1) y = np.eye(3)[y] count = np.shape(data)[0] acc = (count - np.power(y-label,2).sum()/2)/count return acc def train(step,w,b): y = get_result_all(train_data,w,b) loss = -1*(train_label_onhot * np.log(y) +(1-train_label_onhot)*np.log(1-y)).sum() dw = np.matmul(np.transpose(train_data),y - train_label_onhot) db = (y - train_label_onhot).sum(axis=0) w = w - learning_rate * dw b = b - learning_rate * db return w, b,loss loss_data = {'step':[],'loss':[]} train_acc_data = {'step':[],'acc':[]} test_acc_data={'step':[],'acc':[]} for step in range(3000): w,b,loss = train(step,w,b) train_acc = eval(train_data,train_label_onhot,w,b) test_acc = eval(test_data,test_label_onhot,w,b) loss_data['step'].append(step) loss_data['loss'].append(loss) train_acc_data['step'].append(step) train_acc_data['acc'].append(train_acc) test_acc_data['step'].append(step) test_acc_data['acc'].append(test_acc) plt.plot(loss_data['step'],loss_data['loss']) plt.show() plt.plot(train_acc_data['step'],train_acc_data['acc'],color='red') plt.plot(test_acc_data['step'],test_acc_data['acc'],color='blue') plt.show() print(test_acc_data['acc'][-1])
[png]
0.9666666666666667从上述运行结果中来看，达到了96.67%的预测准确度。还不错！
