MethSurv——一个优秀的TCGA甲基化分析工具

  • 2019 年 10 月 7 日
  • 筆記

谈起TCGA分析工具,我知道你肯定要说什么 GEPIA,cbioportal……, 但是 TCGA甲基化呢? 这些碉堡的神器瞬间就黯然失色了吧,数风流神器,还看白介素同学推荐,首先来看下今天要分享的神器有哪些NB功能吧:

MethSurv网页地址:https://biit.cs.ut.ee/methsurv/

感兴趣的基因甲基化位点与预后的关系,生存曲线:

一键出图,甲基化分布情况:

超级酷的小提琴图,展示甲基化与感兴趣的临床表现之间的关系:

高颜值图片全部可用直接下载,放到自己的paper中的,计算出 HR,提供一系列其它数据库的链接, genecards, COSMIC, GO数据库等。

还可根据染色体选择分析:

分析感兴趣的基因甲基化在多肿瘤中的关系,随时出图 KM plot

提供各种肿瘤中的 Top biomarker

还有惊喜,超酷的热图免费送,自动出图,可以拿去发表了

本科研神器还提供数据下载,即甲基化位点在TCGA肿瘤中的预后分析,单因素和多因素都有,且提供TCGA甲基化数据的矩阵数据,已经处理好了,拿来即用!

好了,今天的内容就分享到这,想要这个神器嘛???